Создание САДУМ в тяжелые годы войны значительно повысило мобилизационный дух мусульман Среднеазиатского региона. В годы войны Эшон Бабахан призвал мусульман Средней Азии организовать сбор средств и сельхозпродукции для фронта. Разъяснительная работа муфтията САДУМ через имамов-хатыбов позволила мусульманам региона еще более четко осознать губительность фашизма. Мусульмане вместе со всеми свободолюбивыми народами поднялись на беззаветную борьбу против «коричневой чумы», презирая страх и смерть. Чувство великого долга перед Родиной вдохновляло их на героическую борьбу на всех фронтах войны, они достойно трудились и в тылу.

Осенью 1943 года Советское правительство дало согласие на создание Духовного управления мусульман Средней Азии и Казахстана в Ташкенте. Так была открыта новая страница в истории Ислама в СССР, определившая развитие уммы на постсоветском пространстве вплоть до сегодняшнего дня.

В годы репрессий и террора, притеснения исламской религии и истребления религиозных служителей в СССР Королевство Саудовская Аравия приостановила на некоторое время дипломатические отношения со страной с коммунистической идеологией и воинствующим атеизмом. Однако, благодаря усилиям муфтия Эшона Бабахана, в 1945 году был восстановлен ежегодный обряд хаджа – паломничества в священные города Ислама Мекку и Медину, первая группа из 22-х мусульман СССР во главе с муфтием Эшоном Бабаханом ибн Абдулмажидханом отправилась в хадж.